Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH3RF3Q8TEJ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH3RF3Q8TEJ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SH3RF3Q8TEJ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms