Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
PMFBP1Q8TBY8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PMFBP1Q8TBY8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PMFBP1Q8TBY8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PMFBP1Q8TBY8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PMFBP1Q8TBY8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms