Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RP9Q8TA86 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RP9Q8TA86 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RP9Q8TA86 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RP9Q8TA86 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms