Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATL2Q8NHH9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATL2Q8NHH9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATL2Q8NHH9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL2Q8NHH9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms