Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW1

COL22A1, Collagen alpha-1(XXII) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL22A1Q8NFW1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
COL22A1Q8NFW1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
COL22A1Q8NFW1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL22A1Q8NFW1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
COL22A1Q8NFW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL22A1Q8NFW1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms