Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SPTSSBQ8NFR3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SPTSSBQ8NFR3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SPTSSBQ8NFR3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms