Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACVR1CQ8NER5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACVR1CQ8NER5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACVR1CQ8NER5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms