Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BBOF1Q8ND07 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BBOF1Q8ND07 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BBOF1Q8ND07 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BBOF1Q8ND07 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms