Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8D1

PDCD7, Programmed cell death protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD7Q8N8D1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCD7Q8N8D1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDCD7Q8N8D1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD7Q8N8D1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDCD7Q8N8D1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCD7Q8N8D1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms