Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00337Q8N6G1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00337Q8N6G1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms