Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRACR2BQ8N4Y2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRACR2BQ8N4Y2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRACR2BQ8N4Y2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRACR2BQ8N4Y2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms