Protein–RNA interactions for Protein: Q8N434

SVOPL, Putative transporter SVOPL, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPLQ8N434 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SVOPLQ8N434 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SVOPLQ8N434 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SVOPLQ8N434 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SVOPLQ8N434 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SVOPLQ8N434 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms