Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZNF444Q8N0Y2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF444Q8N0Y2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZNF444Q8N0Y2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ZNF444Q8N0Y2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF444Q8N0Y2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF444Q8N0Y2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZNF444Q8N0Y2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF444Q8N0Y2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF444Q8N0Y2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZNF444Q8N0Y2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms