Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Colec12Q8K4Q8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Colec12Q8K4Q8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Colec12Q8K4Q8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms