Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rdh16f2Q8K3M1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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