Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mtmr3Q8K296 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Mtmr3Q8K296 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Mtmr3Q8K296 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Mtmr3Q8K296 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
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