Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Polr1eQ8K202 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Polr1eQ8K202 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Polr1eQ8K202 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms