Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FgbQ8K0E8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FgbQ8K0E8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FgbQ8K0E8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FgbQ8K0E8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1025.8 ms