Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ8

SUGP1, SURP and G-patch domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUGP1Q8IWZ8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SUGP1Q8IWZ8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SUGP1Q8IWZ8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SUGP1Q8IWZ8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms