Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUQ4

SIAH1, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH1Q8IUQ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SIAH1Q8IUQ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SIAH1Q8IUQ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SIAH1Q8IUQ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SIAH1Q8IUQ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms