Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RIOX2Q8IUF8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIOX2Q8IUF8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIOX2Q8IUF8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIOX2Q8IUF8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms