Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mterf1aQ8CHZ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mterf1aQ8CHZ9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mterf1aQ8CHZ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mterf1aQ8CHZ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.8 ms