Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab11fip3Q8CHD8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab11fip3Q8CHD8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rab11fip3Q8CHD8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rab11fip3Q8CHD8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms