Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rdh13Q8CEE7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rdh13Q8CEE7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rdh13Q8CEE7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rdh13Q8CEE7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms