Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE50

Snx30, Sorting nexin-30, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx30Q8CE50 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx30Q8CE50 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx30Q8CE50 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx30Q8CE50 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx30Q8CE50 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 252.2 ms