Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc27Q8CD92 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc27Q8CD92 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ttc27Q8CD92 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ttc27Q8CD92 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttc27Q8CD92 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttc27Q8CD92 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttc27Q8CD92 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc27Q8CD92 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttc27Q8CD92 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttc27Q8CD92 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms