Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn5Q8CBA2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slfn5Q8CBA2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn5Q8CBA2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slfn5Q8CBA2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms