Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q2

Zhx3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zhx3Q8C0Q2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zhx3Q8C0Q2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zhx3Q8C0Q2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Zhx3Q8C0Q2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zhx3Q8C0Q2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms