Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cldn17Q8BXA6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cldn17Q8BXA6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Cldn17Q8BXA6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms