Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Pbrm1Q8BSQ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Pbrm1Q8BSQ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Pbrm1Q8BSQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Pbrm1Q8BSQ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Pbrm1Q8BSQ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Pbrm1Q8BSQ9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Pbrm1Q8BSQ9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Pbrm1Q8BSQ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms