Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TicrrQ8BQ33 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TicrrQ8BQ33 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TicrrQ8BQ33 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TicrrQ8BQ33 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TicrrQ8BQ33 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms