Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tcaf1Q8BNE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tcaf1Q8BNE1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tcaf1Q8BNE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tcaf1Q8BNE1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tcaf1Q8BNE1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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