Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Usp54Q8BL06 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Usp54Q8BL06 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Usp54Q8BL06 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Usp54Q8BL06 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Usp54Q8BL06 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms