Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GopcQ8BH60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GopcQ8BH60 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GopcQ8BH60 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GopcQ8BH60 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms