Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Bhlhe23Q8BGW3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Bhlhe23Q8BGW3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Bhlhe23Q8BGW3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Bhlhe23Q8BGW3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms