Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smndc1Q8BGT7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smndc1Q8BGT7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smndc1Q8BGT7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smndc1Q8BGT7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smndc1Q8BGT7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smndc1Q8BGT7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smndc1Q8BGT7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smndc1Q8BGT7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smndc1Q8BGT7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smndc1Q8BGT7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Smndc1Q8BGT7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms