Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGI4

Fam13a, Protein FAM13A, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam13aQ8BGI4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam13aQ8BGI4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam13aQ8BGI4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam13aQ8BGI4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fam13aQ8BGI4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Fam13aQ8BGI4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms