Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Necab1Q8BG18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Necab1Q8BG18 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Necab1Q8BG18 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Necab1Q8BG18 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Necab1Q8BG18 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms