Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnpo1Q8BFY9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnpo1Q8BFY9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tnpo1Q8BFY9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnpo1Q8BFY9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tnpo1Q8BFY9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo1Q8BFY9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo1Q8BFY9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo1Q8BFY9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo1Q8BFY9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo1Q8BFY9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo1Q8BFY9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnpo1Q8BFY9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.8 ms