Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFU0

Rspo2, R-spondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo2Q8BFU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rspo2Q8BFU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rspo2Q8BFU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rspo2Q8BFU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rspo2Q8BFU0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rspo2Q8BFU0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rspo2Q8BFU0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rspo2Q8BFU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rspo2Q8BFU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rspo2Q8BFU0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rspo2Q8BFU0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms