Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y37

CACUL1, CDK2-associated and cullin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACUL1Q86Y37 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACUL1Q86Y37 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACUL1Q86Y37 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CACUL1Q86Y37 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACUL1Q86Y37 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACUL1Q86Y37 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CACUL1Q86Y37 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms