Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
H2-M10.4Q85ZW8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
H2-M10.4Q85ZW8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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