Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rbbp8Q80YR6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rbbp8Q80YR6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rbbp8Q80YR6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms