Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ttll4Q80UG8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ttll4Q80UG8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ttll4Q80UG8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ttll4Q80UG8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ttll4Q80UG8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms