Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ube3cQ80U95 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ube3cQ80U95 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ube3cQ80U95 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ube3cQ80U95 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ube3cQ80U95 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms