Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMC6Q7Z403 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMC6Q7Z403 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMC6Q7Z403 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMC6Q7Z403 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms