Protein–RNA interactions for Protein: Q7JJ13

Brd2, Bromodomain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd2Q7JJ13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Brd2Q7JJ13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brd2Q7JJ13 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brd2Q7JJ13 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brd2Q7JJ13 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms