Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snd1Q78PY7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snd1Q78PY7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snd1Q78PY7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snd1Q78PY7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms