Protein–RNA interactions for Protein: Q76KJ5

Cd3eap, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eapQ76KJ5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cd3eapQ76KJ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cd3eapQ76KJ5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cd3eapQ76KJ5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms