Protein–RNA interactions for Protein: Q71UM5

RPS27L, 40S ribosomal protein S27-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27LQ71UM5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPS27LQ71UM5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPS27LQ71UM5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RPS27LQ71UM5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms